Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prr29B1ARI9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr29B1ARI9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms