Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp36B1AQJ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms