Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprsB0V2N1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms