Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn3aA2ASI5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms