Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syndig1A2ANU3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms