Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam43bA2AM80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms