Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms