Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc163A2AGD7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms