Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms