Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Frmpd4A2AFR3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms