Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms