Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms