Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrp1bA1Z198 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms