Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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