Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav4-2A0A075B638 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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