Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC100849.2-201ENST00000518324 519 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL590648.3-201ENST00000446962 473 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms