Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IMPG1Q17R60 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms