Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer3W4VSP1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms