Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms