Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms