Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mecp2Q9Z2D6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mecp2Q9Z2D6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms