Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn8Q9Z260 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms