Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HnrnpcQ9Z204 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms