Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms