Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ilf3Q9Z1X4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ilf3Q9Z1X4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ilf3Q9Z1X4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ilf3Q9Z1X4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ilf3Q9Z1X4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ilf3Q9Z1X4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms