Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog1Q9Z160 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog1Q9Z160 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms