Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms