Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolbQ9WVP6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms