Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms