Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp18Q9WTV6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp18Q9WTV6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp18Q9WTV6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp18Q9WTV6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp18Q9WTV6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms