Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms