Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx6Q9R1R0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms