Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col4a3Q9QZS0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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