Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npas3Q9QZQ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas3Q9QZQ0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms