Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc4Q9QZD4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms