Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a3Q9QZB6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms