Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms