Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abt1Q9QYL7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms