Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rdh11Q9QYF1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rdh11Q9QYF1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh11Q9QYF1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh11Q9QYF1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh11Q9QYF1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh11Q9QYF1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rdh11Q9QYF1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rdh11Q9QYF1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh11Q9QYF1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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