Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms