Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chaf1aQ9QWF0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chaf1aQ9QWF0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms