Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp1Q9JLK7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms