Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgm1Q9JLF6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgm1Q9JLF6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tgm1Q9JLF6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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