Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms