Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms