Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms