Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms