Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms