Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr3bQ9JHJ5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms