Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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Tmod3Q9JHJ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms